Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJQ0

Pigb, GPI mannosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PigbQ9JJQ0 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PigbQ9JJQ0 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
PigbQ9JJQ0 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms