Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rpf2Q9JJ80 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rpf2Q9JJ80 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms