Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ercc6l2Q9JIM3 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Paxx-201ENSMUST00000114261 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Ercc6l2Q9JIM3 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ercc6l2Q9JIM3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms