Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG7

Ccdc22, Coiled-coil domain-containing protein 22, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc22Q9JIG7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ccdc22Q9JIG7 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ccdc22Q9JIG7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms