Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIG4

Ppp1r3f, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3F, mousemouse

Predictions only

Length 799 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3fQ9JIG4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Ppp1r3fQ9JIG4 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Ppp1r3fQ9JIG4 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ppp1r3fQ9JIG4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms