Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER60

Scn4a, Sodium channel protein type 4 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,841 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn4aQ9ER60 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Scn4aQ9ER60 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Scn4aQ9ER60 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms