Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQC0

Chst1, Carbohydrate sulfotransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst1Q9EQC0 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Chst1Q9EQC0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Chst1Q9EQC0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chst1Q9EQC0 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Chst1Q9EQC0 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Chst1Q9EQC0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Chst1Q9EQC0 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms