Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ropn1lQ9EQ00 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ropn1lQ9EQ00 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms