Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK6

Sil1, Nucleotide exchange factor SIL1, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sil1Q9EPK6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sil1Q9EPK6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sil1Q9EPK6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sil1Q9EPK6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sil1Q9EPK6 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sil1Q9EPK6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sil1Q9EPK6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sil1Q9EPK6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Sil1Q9EPK6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sil1Q9EPK6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Sil1Q9EPK6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Sil1Q9EPK6 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sil1Q9EPK6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Sil1Q9EPK6 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Sil1Q9EPK6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sil1Q9EPK6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sil1Q9EPK6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sil1Q9EPK6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Sil1Q9EPK6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sil1Q9EPK6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Sil1Q9EPK6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms