Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPB7

Gpr88, Probable G-protein coupled receptor 88, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr88Q9EPB7 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Gpr88Q9EPB7 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms