Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Mrpl4Q9DCU6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Mrpl4Q9DCU6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms