Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Trmt112Q9DCG9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Trmt112Q9DCG9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms