Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Syde1Q9DBZ9 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Syde1Q9DBZ9 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms