Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm6938-201ENSMUST00000123014 771 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 AC160060.2-201ENSMUST00000220151 811 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Tas2r117-201ENSMUST00000068302 1158 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm2012-202ENSMUST00000163263 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm38280-201ENSMUST00000192610 158 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm37440-202ENSMUST00000195572 1227 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Ift43-201ENSMUST00000054565 773 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Tas2r113-201ENSMUST00000079035 930 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Krtap9-1-201ENSMUST00000093936 1044 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm12205-201ENSMUST00000133940 575 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm15061-201ENSMUST00000121076 1046 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Phf11b-201ENSMUST00000166121 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm27216-202ENSMUST00000184100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm37684-201ENSMUST00000192779 355 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Gm18660-201ENSMUST00000199542 629 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Riok3Q9DBU3 AC139323.1-201ENSMUST00000223370 1040 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms