Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAR0

Uncharacterized protein C5orf49 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAR0 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAR0 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAR0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAR0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Q9DAR0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAR0 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAR0 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAR0 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAR0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAR0 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Q9DAR0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAR0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAR0 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Q9DAR0 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Q9DAR0 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms