Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA73

Ccdc89, Coiled-coil domain-containing protein 89, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc89Q9DA73 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Ccdc89Q9DA73 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Ccdc89Q9DA73 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms