Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA69

Ift43, Intraflagellar transport protein 43 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift43Q9DA69 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ift43Q9DA69 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ift43Q9DA69 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms