Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9L5

Actrt2, Actin-related protein T2, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt2Q9D9L5 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Actrt2Q9D9L5 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms