Protein–RNA interactions for Protein: Q9D995

Cntd1, Cyclin N-terminal domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntd1Q9D995 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cntd1Q9D995 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Cntd1Q9D995 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms