Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Arpc5lQ9D898 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Nub1-201ENSMUST00000068825 3269 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Casp7-201ENSMUST00000026062 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Arpc5lQ9D898 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms