Protein–RNA interactions for Protein: Q9D844

Dnajc4, DnaJ homolog subfamily C member 4, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnajc4Q9D844 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Dnajc4Q9D844 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Dnajc4Q9D844 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms