Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Fip1l1Q9D824 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Fip1l1Q9D824 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms