Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L8

Tmigd1, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmigd1Q9D7L8 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tmigd1Q9D7L8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Tmigd1Q9D7L8 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms