Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7L5

2310002L09Rik, RIKEN cDNA 2310002L09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2310002L09RikQ9D7L5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
2310002L09RikQ9D7L5 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
2310002L09RikQ9D7L5 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms