Protein–RNA interactions for Protein: Q9D783

Klhl40, Kelch-like protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 621 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl40Q9D783 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Klhl40Q9D783 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Klhl40Q9D783 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms