Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Ccdc94Q9D6J3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Ccdc94Q9D6J3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms