Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6G9

Cmtm5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 156 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm5Q9D6G9 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cmtm5Q9D6G9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cmtm5Q9D6G9 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms