Protein–RNA interactions for Protein: Q9D662

Sec23b, Protein transport protein Sec23B, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23bQ9D662 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Sec23bQ9D662 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sec23bQ9D662 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms