Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5Y1

Ccdc39, Coiled-coil domain-containing protein 39, mousemouse

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Length 937 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc39Q9D5Y1 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Ccdc39Q9D5Y1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Ccdc39Q9D5Y1 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
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