Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

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Length 464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PrameQ9D4Z5 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PrameQ9D4Z5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89 ms