Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Syce1Q9D495 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Syce1Q9D495 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms