Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3W1

Rsph14, Radial spoke head 14 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph14Q9D3W1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Rsph14Q9D3W1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rsph14Q9D3W1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms