Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Y5

Snx20, Sorting nexin-20, mousemouse

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx20Q9D2Y5 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Snx20Q9D2Y5 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
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Snx20Q9D2Y5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Snx20Q9D2Y5 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Snx20Q9D2Y5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Snx20Q9D2Y5 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms