Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2T6

1700034E13Rik, RIKEN cDNA 1700034E13 gene, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700034E13RikQ9D2T6 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
1700034E13RikQ9D2T6 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms