Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Q9D2Q3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
Q9D2Q3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms