Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2D9

Klhdc8b, Kelch domain-containing protein 8B, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc8bQ9D2D9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Klhdc8bQ9D2D9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Klhdc8bQ9D2D9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.1 ms