Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.27
ChtopQ9CY57 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
ChtopQ9CY57 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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