Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY25

Mis12, Protein MIS12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis12Q9CY25 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Mis12Q9CY25 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms