Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE7

Tmed5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed5Q9CXE7 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Tmed5Q9CXE7 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Tmed5Q9CXE7 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms