Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Xrcc3Q9CXE6 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms