Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX11

Utp23, rRNA-processing protein UTP23 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp23Q9CX11 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Utp23Q9CX11 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Utp23Q9CX11 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms