Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Rpusd4Q9CWX4 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Rpusd4Q9CWX4 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
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