Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ddx28Q9CWT6 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms