Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWI3

Bccip, BRCA2 and CDKN1A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BccipQ9CWI3 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
BccipQ9CWI3 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
BccipQ9CWI3 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms