Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Sft2d3Q9CSV6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sft2d3Q9CSV6 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.9 ms