Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRA8

Exosc5, Exosome complex component RRP46, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exosc5Q9CRA8 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Exosc5Q9CRA8 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Exosc5Q9CRA8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms