Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR46

Ska2, Spindle and kinetochore-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska2Q9CR46 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Ska2Q9CR46 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Ska2Q9CR46 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms