Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ykt6Q9CQW1 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ykt6Q9CQW1 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms