Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQC3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CQC3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQC3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQC3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQC3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CQC3 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.7 ms