Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA1

Trappc5, Trafficking protein particle complex subunit 5, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc5Q9CQA1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Trappc5Q9CQA1 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Trappc5Q9CQA1 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms